как один из вариантов - куки. При вызове статьи, записываешь номер раздела из которого ты вызывал статью, при возврате твоя SWF стартует сначала. но считывает куки и переходит на нужный раздел, стирая куки. См. SharedObject()
Второй вариант - использовать передачу переменной(номера раздела) в URL.
Усехов.
А сайт просто загляденье!

и всего то 19 кб!!!!