Если делать так (из явы передаётся переменная varFromJS):
fscommang('getMeVar','anyparams');
trace('varFromJS');
То ничего не получится, так как передача занимает какое-то время, а точнее должен закончится ЭкшнСкрипт в этом фрейме и только тогда выполнится ЯваСкрипт, обрабатывающий fscommang! Т.е. Флэш не ждёт завершения обработки fscommang-а.
А зачем передавать переменную из ХТМЛ (да ещё и сгенерённого) через ЯваСкрипт? Тем более, что на маках и в НН6 это не работает? Проще передавать так:
<param name="movie" value="my.swf?varFromJS=hello!">
<embed src="my.swf?varFromJS=hello!" swlifeconnect="true" ... >
Тогда переменная varFromJS будет присутствовать во флэше с самого начала проигрывания мува!