[derhab]

Да да, вручную. Назначаешь своей земле модификатор Edit Mesh, там внизу свитка есть selected by id, дальше кликаешь на нужный тебе полигон, он маркируется красным, потом на кнопку "selected by id" и вписываешь в открывшемся окошке идентификационный номер, например 1. Можешь 1 присвоить всем "водяным" полигонам. Дальше открываешь Материал эдитор, жмешь кнопку стандарт, выбираешь мульти/суб-обьект, выбираешь там свою единицу и присваеваешь ей материал. Это как-бы подматериал, его можно обрабатывать как основной, но независимо от него.