[Timofey]

Что значит ошибка
malformed header from script. Bad header=URL #1: c:/usr/apache/cgi-bin/chemp_cgi/check/checking.cgi

и как с ней бороться, стока
print "Content-Type: text/html\n\n";

стоит в самом начале скрипта на Perl'e, скрипт большой много разных if, и в зависимости от них формируется html, и некоторых случах вываливается
Internal Server Error ...
с такой вот ошибкой в логе, в скрипте еще используется CGI для uploada