То есть, вам нужно вызвать c++ функцию в программе, запущенной на сервере? Сформулируйте вопрос более ясно.
Для внешнего вызова в программе, содержащей swf есть
ExternlaInterface (Например JS в браузере)
Если нужно обратиться к отдельно запущенной программе, на этой же машине или на любом удалённом сервере, есть классы Loader, URLRequest, Socket или XMLSocket.