В SQLite есть возможность проверки версии при помощи PRAGMA schema_version/user_version, к сожалению в AS PRAGMA не поддерживается. Если отличия при обновлении заключаются в количестве/наименовании полей в таблицах - можно сверять хэши наименований таблиц в БД, схему таблицы можно получить при помощи
SQLConnection.loadSchema(). Но это так, идея на скорую руку, может есть какой-то более цивилизованный способ.