[Akopalipsis]

Не денутся.. Можно уточнить,

которым нет дела до ссылок на них в каком-то там массиве

дисплей обжектам ссылки в массиве не помешают удалиться?

var container:Sprite = new Sprite();
$doc.addChild(container);
var array:Array = [];
var sp:Sprite
var spX:int = 0;
var spY:int = 0;
for (var i:int = 0 ; i < 10 ; i++)
{
	sp = new Sprite();
	sp.graphics.beginFill(0xFC1D55);
	sp.graphics.drawCircle(spX, spY, 50);
	sp.graphics.endFill();
	array[i] = sp;
	container.addChild(array[i] as DisplayObject);
	spX += 50;
}
while (container.numChildren)
{
	container.removeChildAt(0)
}
//или сразу всех container.removeChildren();