В каком редакторе писать код неважно - Flash Builder, Flash Develop, Flash Professional cs6 ... хоть в блокноте.
AIR - основа любого приложения на мобилках. Но его бояться не стоит, для многих приложений вообще фиолетово запускаться на AIR или flash player - только настройки проекта менять. AIR в основном отличает возможность работать с жёстким диском/флешкой устройства.