А если

Код AS3:
var _Enemy01:Enemy01 = new Enemy01();
заменить на

Код AS3:
var _Enemy01:Sprite = new Sprite();
тормоза остаются?
А если на

Код AS3:
var _Enemy01:MovieClip= new MovieClip();
?
Добавлено через 2 часа 0 минут
В общем, Вы что-то не так делаете.
Провел испытания:
1. Кидаем в массив 100000 спрайтов - на FPS никак не сказывается и грузится мгновенно
2. Кидаем в массив 100000 мувиков с анимацией (я кидал микропрелоадер "крутящееся колесико") - грузится долго и FPS падает катастрофически
3. Кидаем в массив 100000 тех же мувиков, но с остановкой анимации - грузится долго, но на FPS не влияет
Думаю, Вы просто не остановили анимацию.