Ничего так себе задачку подкинули.
Нашел тут на адобовском форуме вопрос похожий, там чувак делал колор-пикер.
Рабочий код функции выглядит так:

Код AS3:
function setColourFor(e:ColorPickerEvent){
var image:InteractivePNG = getChildByName(type) as InteractivePNG; // movieClip
var bitmap:Bitmap = image.getChildAt(0) as Bitmap; // loaded PNG
var c:ColorTransform = bitmap.transform.colorTransform;
bitmap.transform.colorTransform = new ColorTransform();
c.color = e.color; // colorpickerevent
// bitmap.transform.colorTransform = c;
bitmap.transform.colourTransform(bitmap.bitmapData.rect, c);
}
Закоменчен начальный код задавшего вопрос, последняя строчка - решение проблемы