Убираете весь код с таймлайна.
В свойствах документа указывает класс Main.
Создаете *.as файл с именем Main, там же где ваш *.fla

Код AS3:
package {
import flash.display.Sprite;
import flash.events.Event;
public class Main extends Sprite {
private var _myClip:*;
public function Main():void {
if (stage) {
init();
} else {
addEventListener(Event.ADDED_TO_STAGE, init);
}
}
private function init(e:Event = null):void {
removeEventListener(Event.ADDED_TO_STAGE, init);
_myClip = new MyClip();
addChild(_myClip);
_myClip.x = 40;
addEventListener(Event.ENTER_FRAME, moveDowm);
}
private function moveDowm(e:Event):void {
_myClip.y += 0.5;
//проверяем когда нам надоест движение и удаляем
if (_myClip.y > 300) {
removeEventListener(Event.ENTER_FRAME, moveDowm);
removeChild(_myClip);
_myClip = null;
//допустим показываем другой клип из библиотеки, который содержит анимацию на 100 кадров
somethingElse();
}
}
private function somethingElse():void {
_myClip = new MyAnotherClip();
addChild(_myClip);
_myClip.addEventListener(Event.ENTER_FRAME, theEnd);
}
private function theEnd(e:Event):void {
if(_myClip.currentFrame == 100){
_myClip.removeEventListener(Event.ENTER_FRAME, theEnd);
_myClip.gotoAndStop(100); //останавливаем на 100 кадре
}
//делаем что-нибудь еще
}
}
}
Может поможет.
С кодом на кадрах я вам не помогу, ибо не в курсе нюансов.
Вроде обычно создают отдельный "слой" и в первом кадре пишут весь код.