[DaFive]

Вообще Flash PRO больше для дизайнеров, художников, аниматоров. Если вам нужно рисовать графику - рисуйте её там, а собирайте проект во FlashDevelop или Flash Builder.
С другой стороны проект можно сделать и из Flash Pro, но код все равно будете писать в другом редакторе, ибо писать его во флеш про нереально.
Нужен Flex - опять же Flashdevelop или Flash Builder.

Добавлено через 1 минуту
Ну плюс разница в финансовой стороне вопроса об использовании сред разработки.