Для рисования (визуализации) вам понадобится (если нужен, конечно) класс
Graphics, полезны будут
moveTo,
lineTo и т.д.
Для хранения координат можно использовать классы
Point или
Vector3D.
Нарисовать можно так:

Код AS3:
// Создаете Point'ы:
var p1:Point = new Point();
p1.x = 0;
p1.y = 0;
var p2:Point = new Point();
p2.x = 100;
p2.y = 100;
// создаете фигуру для отображения
var v1:Shape() = new Shape();
// рисуем линию
v1.Graphics.moveTo(p1.x, p1.y);
v1.Graphics.lineTo(p2.x, p2.y);
С расчетами разберитесь и «рисуйте».