В молехил нельзя использовать текстуру кроме битмапы (возможно, пока), но, как вариант, если у вас несложная фигура (например, куб, на вращение которого не уйдет много ресурсов), вам необязательно использовать stage3D.
Посмотрите
пример у Silin, обратите внимание: чекбоксы работают, анимация воспроизводится.