Спасибо. Ваше первое предположение по поводу причины ошибки оказалось верным. Действительно лоаер под индексом идущим по порядку может быть вовсе не тем. Странно что это сказалось только при открытии через браузер.
Решил следующим образом -
1) Расширил класс Loader

Код AS3:
package {
import flash.display.Loader;
/**
* ...
* @author Svetlov
*/
public class Multiloader extends Loader {
public var index:int;
public function Multiloader() {
}
}
}
Ну и в коде сделал соответсвующие правки, вместо индксов по порядку взял индекс объекта лоадера передаваемого в объекте события.