Да уже нашел решение.

Код AS3:
protected function init(event:FlexEvent):void
{
....
nameScroller.viewport.addEventListener(PropertyChangeEvent.PROPERTY_CHANGE, onPropertyChange_nameScroller);
}
private function onPropertyChange_nameScroller(event:PropertyChangeEvent):void
{
if (event.source == event.target && event.property == "verticalScrollPosition")
mainContainer.callLater(updateGraphics);
if (event.source == event.target && event.property == "horizontalScrollPosition")
mainContainer.callLater(updateGraphics);
}
protected function updateGraphics():void
{
// drawingLines - класс, где происходит работа с рисованием на экране в mainContainer.graphics
drawingLines.nameMethodForDrawLines();
}

Код:
<s:Scroller id="nameScroller" itemCreationPolicy="immediate" width="100%" height="100%">
<s:Group id="mainContainer" width="100%" height="100%">
...
...
</s:Group>
</s:Scroller>