[Sociofilm]

да, похоже вы правы, <embed> хоть и отображает в IE флэшку и даже позволяет её использовать, но ExternalInterface при этом теряется (хотя обратная связь с флэша на JS связь есть). Сделал отдельно для IE внедрением через <object>, для остальных нетскейпообразных оставил как было.