[wvxvw]

Да есть же нормальные криптографические алгоритмы и реализации, и для двунаправленного шифрования в том числе, зачем вам велосипед с квадратными колесами?
Но, опять же, защищать программу саму от себя звучит как-то... непонятно. Есть смысл защищать клиентские данные от сервера, или сервер от клиента, но таким образом, как вы это предлагаете сделать, вы ничего не добъетесь, ну только запутаете, еще не известно кого больше, себя или злоумышленника.
Обычно обфускации хватает для того, чтобы свести к минимуму попытки безхитростного взлома. Но вот защитить полностью в такой ситуации не возможно.