Тогда вам нужно:
1) Указать
scale: "noScale".
2) Почитать про
ExternalInterface для взаимодействия флешки с JavaScript.
3) Создать во флешке функцию, которая будет вызываться из JavaScript при изменении размеров окна браузера.
4) И вызывать ее. Передавать флешке, разумеется, нужно размеры экрана. JavaScript код выглядит примерно так:

Код:
function resize (event) {
var obj = swfobject.getObjectById("mySWF");
if (obj) {
// Передаем во флешку объект
var someObject = { one:"Hello", two:", world!" };
obj.toFlash(someObject);
}
}
// Вешаем прослушку ресайза окна
// (в терминах JavaScript это наверняка звучит не так)
window.onresize = resize;
// И позже, когда встраиваем флешку
var attributes = { id: "mySWF" };
swfobject.embedSWF("your_movie.swf", "altContent", "100%", "100%", "10.0.0", "expressInstall.swf", flashvars, params, attributes);
5) А зная размеры экрана, уже позиционировать элементы во флешке.