Я очень рад, что вам понравился мой проект
Относительно скайпа, то вскоре можно будет работать с заголовками окон, и соответственно можно будет определить с каким именно пользователем вы общаетесь в данный момент.
А по сайтам, то это уже тестируем. Думаю, что поддержка сайтов войдет в декабрьский релиз Motivate Clock.