Разобрался с магией ссылок, сделал так:

Код AS1/AS2:
activeTextArea.appendHtml("<a href='asfunction:...,link-span'><span class='ngreen'>Link-span</span></a>\n");
activeTextArea.appendHtml("<span class='ngreen'><a href='asfunction:...,span-link'>Span-link</a></span>\n");
В ксс:

Код:
.ngreen
{
color: #99CC00;
font-size: 14px;
font-weight: normal;
}
Обе ссылки красились в зеленый.
При добавлении в ксс

Код:
a:link
{
color: #FFFFFF;
font-size: 14px;
font-weight: normal;
}
Вариант 1. Стал зеленым, а 2 остался белым.