Тогда могу предположить, что функция checkPortal вызывается слишком часто и твинер все время обновляется, так и не завершившись.
По какому событию вызывается эта функция?

Код AS3:
public function checkPortal(e:Event):void
enterFrame?
Если да, то логичнее будет написать так:

Код AS3:
public function checkPortal(e:Event):void
{
if (mc.hitTestObject(portalExit.area))
{
portalExit.removeEventListener(Event.ENTER_FRAME, checkPortal);
pause2();
Tweener.addTween(mc, {alpha:0,time:0.5,x:portalExit.x,y:portalExit.y-20,transition:"linear", onComplete:removeExit2});
}
}
Вообще, у меня лично caurina tweener всегда идеально работал. Никогда не наблюдалось подобных глюков.
Сам твин движок скачан с оф сайта?