Ну, смотрите... код сгенеренный в FB может быть полезным в некоторых ситуациях:
- что-то потестировать (просто быстрее сгенерить, чем написать).
- для совсем новичков, которые сами не напишут.
Но использовать в настоящем работающем приложении... я бы даже не задумывался о такой возможности

Что до Zend - я знаком только с Zend_Amf. Это по сути продолжение AMFPHP, которое один из коммитеров решил приладить к Zend, и его поддержали. На первый взгляд, то, что касалось сериализации / общения с клиентом не поменялось, но добавилась куча мусора связанного с Zend фреймворком, ну и ограничения на имена файлов / классов и т.п. Кроме того, из-за того, что нужно было приткнуть "архитектуру" к уже работающей библиотеке, библиотека стала работать хуже

В смысле медленнее.
Ну и в целом про Flex говорить бы не стал тоже

есть и позитивные моменты. Но мое глубокое убеждение, что шаблоны хороши только тогда, когда
- точно знаешь какой код из них создается.
- есть возможность их поменять, если нужно.
Первое достижимо методом проб и ошибок, второе - никак, если мы говорим про Flash Builder... но это, судя по всему идеология разработчиков такая, смысл которой от меня ускользает.