[mooncar]

Исходите из того, что в скомпилированном ролике слоев нет, слои присутствуют только в программе Adobe Flash.

Для управлением перекрытием объектов нужно использовать глубины. Глубины - это как бы положение объектов по z-оси. При компиляции из Adobe Flash объекты принимают глубины сообразно их положению в авторской среде.
Для того, чтобы переместить объект по z-оси с помощью AS, он либо сам должен являться символом типа MocveClip, либо находится внутри мувиклипа, который и следует использовать.
Для установки глубины используются метод MovieClip.swapDepths().
PS. Программно созданные или приаттаченные мувики имеют положительные глубины, а те мувики, которые рисуются в авторской среде, автоматически принимают отрицательные значения.