Контроль билдов во FlashDevelop'e
 

Есть ли такие макросы или плагины, позволяющие при каждой компиляции из-под ФлешДевелопа прибавлять где-нибудь в коде порядковый номер билда? Очень интересно было бы проследить, как развивались версии.
Насколько я знаю, кажется, есть программы, позволяющие даже сохранять каждую новую версию скомпилированной программы отдельно.

Советую взглянуть в сторону автоматизации билдов с использованием Ant/Maven. Как бонус — кроссплатформенность и кросс-IDE'йность этих самых билдов.

аж две ветки таких плагинов
http://www.flashdevelop.org/communit...php?f=4&t=6423
http://www.flashdevelop.org/communit...php?f=4&t=6150

еще FD в каждой компиляции определяет CONFIG::timeStamp, можно по-простому его использовать для пометки даты компиляции

Возможно вы имеете в виду системы контроля версий. Наиболее популярных две: SVN, git. Но они не только
версии скомп. программ хранят, но и запоминают каждое изменение в source-файлах и вообще изменения
в любых файлах, которые захотите.