flex и cookie,
 

возможно ли средствами flex или flash получить куки, не встраивая саму флешку в html?

И куки чего вы хотите получить в таком случае?

вообщем интересует подключение javascript со стороннего сервера, воможно ли это? если да то какими функциями, дополненияи

Только если у flash есть соответствующее разрешение на использование ExternalInterface.

Смотрите, если вы не встроите флешку в HTML, то вариант взаимодействия с JavaScript у вас всего 1 - AIR и загружать HTML + JavaScript во Флеш... ну или через сторонние программы, например, положить актив-Х на форму .NET и из этой формы уже общаться с HTMLем...
Возможно ли хранить кукис в AIR приложении - я чесно не знаю, но есть шанс, что возможно... надо пробовать.

В принципе, если у пользователя установлен автономный плеер (вероятность ничтожно мала), то флешку можно отобразить и без участия HTML в браузере... но, я думаю, что такой вариант не рассматривается... И, я чесно не знаю, на сколько в таком режиме флеш сможет взаимодействовать с окружением, но, скорее всего не будет взаимодействовать никак...

прочитать cookie на Flex можно ТОЛЬКО через Socket. На AIR с этим все в порядке, есть спец лиснер.