Если смысл сделать так, чтобы флэшка игралась только в предзагрузчике, надо хранить в предзагрузчике критически важный фрагмент. Но конечно ничто не помешает разобрать и предзагрузчик. Однако, если вас устраивает результат после обработки обфускатором - это метод, делающий простую поимку адреса свф бессмысленным.
В любом случае задача выглядит так - как загрузить флэшку, не загружая ее.