Это между строк написано.
Для добавления объекта в дисплейный список, используется тег PlaceObject2 или PlaceObject3 (расширен для использования blendmode), у него есть обязательное поле Depth, по которому идентифицируется символ, а вовсе не по имени. Соответственно, раз глубина изменилась, то идентифицировать символ нельзя, но быть то он должен, мы ведь попали на ключевой кадр, а в нем опять выполняется содержимое тега PlaceObject2, поэтому создается новый символ.

Не совсем понятно...
Если кадр пустой, но является ключевым, то в нем по-любому какие-то символы ищутся?

Только те, что описываются в swf.

При заходе на первый кадр плеер читает файл. Там сказано, что на втором кадре на глубине -16...... находится экземпляр символа .... Плеер его туда и помещает. Экземпляр, висящий в это время на глубине 10, в файле свф не описан - он там появился программно. Поэтому с ним плеер ничего не делает (в смысле не удаляет, как надо бы по идее) В результате у нас два экземпляра, что самое неприятное - с одинаковым instance name.

to iNils:
а какие описываются в swf?

to Wolsh:
И как же тогда решать проблему двух клипов с одинаковыми инстанснеймами?
Это же из-за такого по незнайке можно мозг себе сломать чтоб выявить причину глюков...

Созданные в среде разработке и помещенные на таймлайна.
Не должно быть двух клипов с одинаковым именем.

Да просто надо либо анимашки делать на таймлайне, либо программировать. Если второе, то забываем про кадры и наслаждаемся компанией из аттач/ремув и событий. Надо не решать проблему с именами, а не допускать ее возникновения. Не должно быть второго клипа, не будет и проблемы с именами)

1000 извинений если это уже оффтоп, но как же не допускать если в данном случае их создалось два и при чем, как Вы говорите, с одинаковыми именами?
Я с таким, просто, еще не сталкивался, но смотрю что тема такая можно рано или поздно на такие грабли наступить,
вот и пытаюсь для себя уяснить что к чему.

Либо работаешь "вручную", т.е. ручками раскладываешь все клипы по местам и забываешь про программную манипуляцию глубинами, либо все клипы аттачишь из библиотеки.